Vissza a Sorozatokhoz
2. Évad
Összefoglaló
A város megsegítésére megérkezik a Daedalus nevű csatahajó, melynek segítségével megelőző támadásra indulnak Atlantisz védői, és magával hoz a fedélzetén egy teljesen feltöltött ZPM-et, amely a város pajzsát látja el energiával. Megkezdődik az ostrom, ami közben Ford egy bizarr átalakuláson megy át: félig lidérc, félig ember lesz. A lidércek táplálkozáskor egy enzimet bocsátanak az ember testebe, ami megerősíti a szívet, hogy az áldozat ne haljon meg idő előtt.] Ez alapvetően megváltoztatja az expedíció tagjaihoz fűződő kapcsolatát. A lidérc támadást sikerül visszaverni. Az évad fő történeti szála a Carson Beckett által felfedezett retrovírus, amely képes egy lidércet emberré változtatni. A retrovírust tesztelik egy lidércen, Michaelen is, de változó sikerekkel. Az évad végén az expedíciónak szövetséget ajánl Michael csoportja, ám a végén elárulják őket. Az évad azzal zárul, hogy megtudjuk: a lidércek a Föld felé tartanak.
Epizódok

Az ostrom III.
A város megsegítésére megérkezik a Daedalus nevû csatahajó, amelynek segítségével megelõzõ támadásra indulnak Atlantisz védõi. Közben Ford egy bizarr átalakuláson megy át, mely alapvetõen megváltoztatja az expedíció tagjaihoz fûzõdõ kapcsolatát.

A betolakodó
A csapat visszafelé tart a Földrõl Atlantisz felé, amikor a hajójuk irányíthatatlanná kezd válni.

Az üldözött
Az egyik kutatócsapat Ford nyomaira bukkan, akit egykori társai próbálnak megnyugtatni és hazahívni. Fogságba ejti õket azonban egy Ronan Dex nevû férfi, aki ugyanezen a bolygón rejtõzködött el.

Duett
Egy lidérc támadás után McKay nem teljesen önmaga, mert a testét meg kell osztania egy kollegájával. A furcsa viselkedése miatt bolondnak tartják.

Elítélve
Sheppardék egy vad civilizáció elõl menekülve egy fejlett városba jutnak, amelyrõl kiderül, hogy politikai tárgyalásokat folytat a lidércekkel.

Szentháromság
McKay megpróbál tökéletesíteni egy olyan Õs energiatermelõ technológiát, mely hamarosan nem várt fordulatot vesz. Teyla és Ronan egy Belkan nevû kereskedõcsoportot látogat meg, ahol megtudják, hogy a férfi világának vannak túlélõi és közöttük van egykori mestere is.

Ösztön
A csapat egy elzárt világ lakóinak kérésére lidérc utáni hajtóvadászatba kezd. Megdöbbenve veszik tudomásul, hogy egy fiatal lidérc lány együtt él egy apjának tartott emberrel, aki a speciális fõzetének köszönhetõen mesterségesen el tudja nyomni az éhséget. Dr. Beckett megpróbálja a kivonat titkát felfedni.

Átváltozás
Dr. Beckett retrovírusa miatt Sheppard egy furcsa átalakuláson megy keresztül.

Aurora
Lefagyasztott Õsöket találnak Sheppardék, akikkel megpróbálják felvenni a kapcsolatot.

Az elveszett fiúk
Ford egy különleges csoport vezetõjeként visszatér, hogy egy kaptárhajó elleni támadáshoz segítséget kérjen Atlantisztól.

A kaptár
Sheppard fogságba esik a lidérc hajóban, miután Ford terve nem úgy sül el, ahogy szerették volna.

Megvilágosodás
Sheppard idõtorzulás miatt közel egy évig magára marad egy olyan bolygón, amelynek lakói Õsök.

Kritikus tömeg
A várost megtámadja egy Goa’uld, aki egy bombát helyez el az egyik épületben.

A tenger mélyén
McKay a tenger mélyén találja magát egy Puddle Jumperben, ahol Sam Carter érkezik a segítségére.

A torony
Az egyik civilizáció egy fejlett Õs szerkezetnek köszönhetõen sértetlenül vészelte át az elmúlt évszázadokat, de az uralkodói házban kitört viszályban Sheppard csapatának kellene döntést hoznia.

Hosszú búcsú
Weir és Sheppard fenyegetést jelentenek a városra, amikor egy idegen életforma veszi át testük felett az irányítást.

Puccs
A Genii újra felbukkan és zsarolással jármûveket akarnak szerezni egy nagyszabású lidérc elleni akcióhoz.

Michael
Michael Kenmore hadnagy egy küldetést követõen amnéziában szenved. A felépülését elõsegítõ terápiában a város vezetése személyesen vesz részt.

Pokol
A csapat egy olyan világba látogat, amely éppen megsemmisül egy vulkán miatt.

Szövetségesek
Michael és egy lidérc királynõ meglepõ ajánlatot tesz a város vezetésének, ha segítenek emberekké alakítani ellenfeleiket Dr. Beckett retrovírusával.